Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Prame-201ENSMUST00000033786 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11737-201ENSMUST00000118713 468 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Rhox7-ps2-201ENSMUST00000197804 322 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm32105-201ENSMUST00000218512 511 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Eri2-203ENSMUST00000106523 973 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
Sft2d1Q5SSN7 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms