Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm25962-201ENSMUST00000157173 168 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AU023762-202ENSMUST00000209716 961 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Usp48Q3V0C5 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Usp48Q3V0C5 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Usp48Q3V0C5 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
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Usp48Q3V0C5 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Usp48Q3V0C5 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Usp48Q3V0C5 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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Usp48Q3V0C5 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Spag17os-202ENSMUST00000145279 3219 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 AC098728.1-202ENSMUST00000226656 2198 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Ttk-201ENSMUST00000070326 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Usp48Q3V0C5 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms