Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Mbnl3-204ENSMUST00000136404 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Nemf-201ENSMUST00000021368 4732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Skil-203ENSMUST00000118204 2904 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm44620-201ENSMUST00000209183 2887 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Slmap-202ENSMUST00000090359 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr671-203ENSMUST00000217091 3225 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm7690-201ENSMUST00000190885 1399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm10568-201ENSMUST00000193244 1634 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Pde6h-203ENSMUST00000204382 211 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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