Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC142273.1-201ENSMUST00000213723 673 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC168274.1-201ENSMUST00000218657 1864 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm44171-201ENSMUST00000203701 2109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm6619-201ENSMUST00000159229 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm44776-201ENSMUST00000207212 381 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm19936-201ENSMUST00000216414 838 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC152979.3-201ENSMUST00000217720 479 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Vmn2r-ps8-201ENSMUST00000177088 898 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trafd1Q3UDK1 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms