Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Mesp1P97309 Gm10717-204ENSMUST00000099056 669 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Mesp1P97309 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Mesp1P97309 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Nsd2-205ENSMUST00000114399 7786 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Dclre1c-201ENSMUST00000061852 7075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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Mesp1P97309 4933416M07Rik-201ENSMUST00000181424 624 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm18838-201ENSMUST00000204855 886 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC170086.2-201ENSMUST00000224733 803 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Mir99ahg-214ENSMUST00000183333 3422 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm136-201ENSMUST00000095129 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 3110067C02Rik-201ENSMUST00000120793 2117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm37553-201ENSMUST00000194135 1602 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Vmn2r14-201ENSMUST00000170341 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Mesp1P97309 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms