Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NcstnP57716 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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NcstnP57716 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NcstnP57716 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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