Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm42510-201ENSMUST00000196470 2258 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
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PtprmP28828 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC122263.1-201ENSMUST00000228636 2805 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm8137-201ENSMUST00000218997 463 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PtprmP28828 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
PtprmP28828 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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