Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm22592-201ENSMUST00000104242 131 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Dlg2-216ENSMUST00000209170 1057 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr628-202ENSMUST00000218266 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr243-201ENSMUST00000098194 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r210-203ENSMUST00000226294 3500 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 CT033778.1-201ENSMUST00000224767 767 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Vmn1r46-201ENSMUST00000075797 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RxraP28700 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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