Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Nop58-215ENSMUST00000191142 9507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm8693-201ENSMUST00000178871 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r138-201ENSMUST00000179206 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r131-201ENSMUST00000179390 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn1r111-201ENSMUST00000179511 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm19065-202ENSMUST00000203910 1165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Rrn3B2RS91 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms