Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Trhr-201ENSMUST00000038856 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Cept1-201ENSMUST00000039153 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm29490-201ENSMUST00000190923 342 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43269-201ENSMUST00000202075 518 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm45850-201ENSMUST00000212536 338 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr976-204ENSMUST00000217630 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr16-202ENSMUST00000215254 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1348-209ENSMUST00000213549 2714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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