Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm11759-201ENSMUST00000121742 464 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 1700001N15Rik-201ENSMUST00000199380 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm37181-201ENSMUST00000192513 1727 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mup2-202ENSMUST00000107490 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Fbxw14-203ENSMUST00000198844 1786 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Grik3B1AS29 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms