Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC152944.1-201ENSMUST00000220160 3101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn1r173-201ENSMUST00000174055 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Mir7687-201ENSMUST00000184722 59 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm7496-201ENSMUST00000192573 1034 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Iapp-201ENSMUST00000041993 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm11743-201ENSMUST00000117385 1735 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr145-201ENSMUST00000086062 6796 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Usp29Q9ES63 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms