Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1039-201ENSMUST00000099910 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zfp182-201ENSMUST00000040628 2487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Fam107b-205ENSMUST00000115055 515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm12317-201ENSMUST00000122307 319 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps67-201ENSMUST00000173843 691 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr231-202ENSMUST00000214446 5204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Arl8b-202ENSMUST00000204483 695 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC138284.2-201ENSMUST00000213982 567 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Vmn2r117-201ENSMUST00000171996 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SgshQ9EQ08 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms