Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC158803.2-201ENSMUST00000219452 679 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC170999.1-201ENSMUST00000226359 1585 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Sdr16c6-201ENSMUST00000095151 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15428-201ENSMUST00000121352 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm43608-201ENSMUST00000197703 687 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm36535-201ENSMUST00000198395 511 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15839-202ENSMUST00000211219 664 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC164087.1-201ENSMUST00000215174 733 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Svs3a-202ENSMUST00000109370 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Klra13-ps-201ENSMUST00000125813 802 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28604-201ENSMUST00000186629 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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