Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Olfr258-ps1-201ENSMUST00000192471 891 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm6145-203ENSMUST00000210557 835 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Ddb2Q99J79 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm23408-201ENSMUST00000158523 265 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm27006-201ENSMUST00000182218 943 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ddb2Q99J79 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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