Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm2309-201ENSMUST00000149994 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr1134-202ENSMUST00000135875 1291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r227-202ENSMUST00000179914 1026 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Rgs17-202ENSMUST00000064225 8191 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC154709.1-201ENSMUST00000222304 446 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ang5-201ENSMUST00000066719 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 AC122034.1-201ENSMUST00000227641 595 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg4aQ8C9S8 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.8 ms