Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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Tsr1Q5SWD9 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tsr1Q5SWD9 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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