Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Myt1l-202ENSMUST00000049784 7202 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Tyr-201ENSMUST00000004770 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Robo2-202ENSMUST00000117200 5988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Snhg14-214ENSMUST00000191191 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 4930528J11Rik-201ENSMUST00000201689 3611 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gabpb2-202ENSMUST00000098873 8272 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm7368-201ENSMUST00000213307 367 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm26760-201ENSMUST00000181901 1604 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Robo2-210ENSMUST00000226478 8059 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Map2-203ENSMUST00000114012 5119 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 AC118639.1-203ENSMUST00000228425 2016 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Shank3Q4ACU6 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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