Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm13531-201ENSMUST00000121893 543 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr213-201ENSMUST00000121958 984 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm15511-201ENSMUST00000152570 557 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 1700044C05Rik-201ENSMUST00000186060 898 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC153845.2-203ENSMUST00000215889 617 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr1133-202ENSMUST00000217368 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Ccl8-201ENSMUST00000009329 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Trp53bp1-202ENSMUST00000110648 9621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Tgif1-202ENSMUST00000118283 1388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm6104-201ENSMUST00000078030 603 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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