Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm25617-201ENSMUST00000179548 133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm25617-202ENSMUST00000198387 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm34215-201ENSMUST00000221599 355 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Zscan4d-201ENSMUST00000067210 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Tpte-201ENSMUST00000077194 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 1700029I15Rik-202ENSMUST00000111280 416 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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Znf48Q3US17 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm37065-201ENSMUST00000191636 444 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Znf48Q3US17 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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