Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr710-201ENSMUST00000055923 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Slco1a1-201ENSMUST00000042119 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28426-201ENSMUST00000187385 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Postn-204ENSMUST00000117373 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13250-201ENSMUST00000117209 753 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12707-201ENSMUST00000155789 489 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
E130208F15RikQ3UPV3 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms