Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 4930480C01Rik-201ENSMUST00000200913 901 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1167-201ENSMUST00000099832 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm44889-203ENSMUST00000208346 1589 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
VdrP48281 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
VdrP48281 Grik1-203ENSMUST00000114137 2894 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm15310-201ENSMUST00000117891 372 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm3127-201ENSMUST00000167839 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Rian-203ENSMUST00000181527 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 AC113204.1-203ENSMUST00000219475 375 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Skint10-202ENSMUST00000068851 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm5321-201ENSMUST00000072050 447 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Prl3d3-201ENSMUST00000073601 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Krtap6-1-201ENSMUST00000076906 594 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
VdrP48281 Gm37435-201ENSMUST00000192078 3947 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.2 ms