Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
PtprkP35822 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Vmn1r6-206ENSMUST00000227847 8073 ntAPPRIS P2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr670-201ENSMUST00000050482 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr446-203ENSMUST00000215686 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr446-204ENSMUST00000216199 4218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr716-206ENSMUST00000215284 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Zfp568-202ENSMUST00000146074 6867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm12131-201ENSMUST00000117479 359 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Adgrg2-207ENSMUST00000112408 4708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 Vdac2-208ENSMUST00000172727 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PtprkP35822 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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