Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gulp1-206ENSMUST00000162600 2798 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr446-202ENSMUST00000215369 4399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1499-202ENSMUST00000216659 1834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gtsf1-202ENSMUST00000123724 747 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Hoxb9P20615 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms