Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

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Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm12901-201ENSMUST00000118690 532 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Cd59b-202ENSMUST00000111130 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Gm340F6RGI3 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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