Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex35-204ENSMUST00000121911 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43130-201ENSMUST00000197721 3907 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3278-201ENSMUST00000164459 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42910-201ENSMUST00000198917 2921 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37205-201ENSMUST00000194820 2736 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms