Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Rapgef6-204ENSMUST00000108894 3475 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 AC102435.1-205ENSMUST00000221064 1097 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Fbxl13-202ENSMUST00000115234 2143 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm12026-201ENSMUST00000120961 1024 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm17091-201ENSMUST00000163248 357 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Obox4-ps9-201ENSMUST00000176927 1136 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm43645-201ENSMUST00000200129 341 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm45752-201ENSMUST00000212917 3186 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr1257-202ENSMUST00000111519 2756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Ccdc6D3YZP9 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms