Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm14326-201ENSMUST00000108928 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm2199-201ENSMUST00000119065 874 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13121-201ENSMUST00000120637 632 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 4930423M02Rik-202ENSMUST00000156903 1205 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm24081-201ENSMUST00000175177 125 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm19168-201ENSMUST00000218804 1091 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm3785-201ENSMUST00000221000 202 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Skint5-204ENSMUST00000171627 1611 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Lrrc31-201ENSMUST00000108263 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC166358.5-201ENSMUST00000220706 1302 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Lig4-202ENSMUST00000170033 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Snora47-201ENSMUST00000157483 138 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm44768-201ENSMUST00000205719 393 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC127279.1-201ENSMUST00000220140 637 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Spocd1B1ASB6 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms