Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm44027-201ENSMUST00000203419 3480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm19136-201ENSMUST00000190706 2067 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm21742-201ENSMUST00000189352 548 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 4833421K07Rik-201ENSMUST00000206146 1391 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Agbl1-201ENSMUST00000026854 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Grik3B1AS29 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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