Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC159263.3-201ENSMUST00000223434 460 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr282-201ENSMUST00000075851 928 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43029-201ENSMUST00000201829 1535 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps130-201ENSMUST00000175853 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps129-201ENSMUST00000177509 2568 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm3106-201ENSMUST00000179743 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-39-201ENSMUST00000103515 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm42850-201ENSMUST00000202094 201 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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