Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm884-201ENSMUST00000059279 10977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Tceanc-203ENSMUST00000180322 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1341-202ENSMUST00000214131 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm10436-201ENSMUST00000071580 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Fxyd1-210ENSMUST00000206012 501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SgshQ9EQ08 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms