Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 CT030124.1-201ENSMUST00000217130 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm36931-201ENSMUST00000192997 4801 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm37226-201ENSMUST00000191644 3255 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr726-208ENSMUST00000217422 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Mir7037-201ENSMUST00000184414 65 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 C4bp-ps1-201ENSMUST00000189393 706 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC121569.2-201ENSMUST00000222557 574 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm14393-201ENSMUST00000072895 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Amy1-201ENSMUST00000067980 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm14369-201ENSMUST00000121355 285 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm9038-201ENSMUST00000203400 604 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC121912.1-201ENSMUST00000227525 1201 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Zzz3-204ENSMUST00000106103 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Ccdc47Q9D024 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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