Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr509-201ENSMUST00000061690 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm14027-201ENSMUST00000135186 622 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm6542-201ENSMUST00000153606 772 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm28353-201ENSMUST00000186482 570 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm28533-201ENSMUST00000186741 570 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm32554-201ENSMUST00000196310 970 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm15818-201ENSMUST00000134692 656 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 A730094K22Rik-201ENSMUST00000193867 740 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms