Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 4930470O06Rik-201ENSMUST00000209438 662 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr618-201ENSMUST00000098197 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC107663.3-201ENSMUST00000225873 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1299-201ENSMUST00000207228 1678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Apobec3Q99J72 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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