Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr1407-ps1-201ENSMUST00000085885 797 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Med12-201ENSMUST00000087948 6809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm8189-203ENSMUST00000211159 1225 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm38562-201ENSMUST00000199398 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC098742.1-201ENSMUST00000227945 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Dlg2-204ENSMUST00000107196 7490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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NipblQ6KCD5 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NipblQ6KCD5 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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