Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 4930512P04Rik-201ENSMUST00000197000 424 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm44281-201ENSMUST00000203090 166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r178-201ENSMUST00000078593 915 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr113-201ENSMUST00000216181 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Phf11c-201ENSMUST00000166912 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Polk-205ENSMUST00000221899 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Zfp280c-201ENSMUST00000072292 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15390-201ENSMUST00000120323 738 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm7670-201ENSMUST00000121272 641 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15011-201ENSMUST00000117724 1480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27617-201ENSMUST00000184321 168 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms