Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm45037-201ENSMUST00000207475 673 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 4930567H12Rik-202ENSMUST00000212512 766 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC125405.1-201ENSMUST00000226406 589 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Slc22a26-202ENSMUST00000120522 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm8220-203ENSMUST00000177877 381 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 4930448F12Rik-201ENSMUST00000220795 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Vmn1r48-201ENSMUST00000073415 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Gm28047Q3US59 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC158779.2-201ENSMUST00000227902 1947 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Prdx2-rs3-201ENSMUST00000117259 594 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm28047Q3US59 Gm12268-201ENSMUST00000118398 442 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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