Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Atf2-203ENSMUST00000100009 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm12635-201ENSMUST00000117285 752 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm11188-201ENSMUST00000122382 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm25363-201ENSMUST00000158850 245 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Scgb2b21-201ENSMUST00000185407 520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm29477-201ENSMUST00000189860 499 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gtsf1l-201ENSMUST00000094653 822 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Slc7a2-201ENSMUST00000057784 7910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Mapre2-202ENSMUST00000115830 2496 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Zfp317-203ENSMUST00000213725 2354 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Znf48Q3US17 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm5843-201ENSMUST00000121631 476 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 5730522E02Rik-208ENSMUST00000179180 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Znf48Q3US17 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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