Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm10999-201ENSMUST00000108743 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm13923-201ENSMUST00000153283 288 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm6145-201ENSMUST00000209522 710 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Polk-201ENSMUST00000022172 4225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Igkv1-132-201ENSMUST00000103305 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28763-201ENSMUST00000188870 166 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29538-201ENSMUST00000190783 471 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm29579-201ENSMUST00000190820 166 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38326-201ENSMUST00000194030 686 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Olfr204-201ENSMUST00000072517 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Trim71Q1PSW8 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms