Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 1700027H10Rik-201ENSMUST00000186818 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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Ttc39dQ0VF76 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Ttc39dQ0VF76 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms