Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm45554-203ENSMUST00000211410 2137 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr325-202ENSMUST00000203418 1649 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm26419-201ENSMUST00000104272 133 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm42799-201ENSMUST00000201331 328 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm4585-201ENSMUST00000207218 452 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ube2dnl2-201ENSMUST00000062695 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm23054-201ENSMUST00000082804 162 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1110-201ENSMUST00000099861 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14895-201ENSMUST00000121858 1361 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Phxr4-202ENSMUST00000216590 1391 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Dnajb7-201ENSMUST00000057236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm32736-201ENSMUST00000200427 2701 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Havcr2-201ENSMUST00000020668 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VdrP48281 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14706-201ENSMUST00000117744 255 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm24680-201ENSMUST00000158759 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Plgrkt-201ENSMUST00000016639 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Dnah7c-201ENSMUST00000178395 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
VdrP48281 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms