Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm45392-201ENSMUST00000210441 214 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm4724-201ENSMUST00000109045 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr427-202ENSMUST00000213832 3866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm24553-201ENSMUST00000158653 131 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Enox2-201ENSMUST00000033437 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Vmn2r32-201ENSMUST00000094866 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Tmem45a2-201ENSMUST00000067173 3073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr879-ps1-201ENSMUST00000212455 694 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Chd1P40201 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Chd1P40201 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Chd1P40201 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Chd1P40201 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Chd1P40201 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Chd1P40201 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Chd1P40201 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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