Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44739-201ENSMUST00000205294 1426 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37814-201ENSMUST00000195820 3644 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23511-201ENSMUST00000083084 164 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Akr1c14-201ENSMUST00000041768 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm37509-201ENSMUST00000194867 3169 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm25422-201ENSMUST00000104219 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mageb6-ps-201ENSMUST00000126612 1032 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm3008-201ENSMUST00000160566 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Mir6973b-201ENSMUST00000184185 80 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RxraP28700 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms