Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 AC160962.1-203ENSMUST00000225167 1105 ntAPPRIS P5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Ccnb3-201ENSMUST00000056725 4475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 AV026068-210ENSMUST00000189169 877 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm43700-201ENSMUST00000200967 316 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm44648-201ENSMUST00000208267 329 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 AC123534.1-201ENSMUST00000224060 656 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Casp4-201ENSMUST00000027012 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm15128-202ENSMUST00000178833 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1484-203ENSMUST00000215567 3699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm28129-201ENSMUST00000186273 537 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm6366-201ENSMUST00000198766 826 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
H2-Eb1P04230 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms