Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp329-202ENSMUST00000108546 2577 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnrhr-201ENSMUST00000031172 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phyhipl-206ENSMUST00000162251 1540 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12909-201ENSMUST00000134190 620 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec2g-206ENSMUST00000204259 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700091H14Rik-202ENSMUST00000185725 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hddc3-209ENSMUST00000206480 454 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 9430078K24Rik-202ENSMUST00000219857 348 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC121137.1-201ENSMUST00000225272 602 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr934-201ENSMUST00000074211 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms