Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm5341-201ENSMUST00000058881 489 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm17791-201ENSMUST00000185660 1501 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Usp14-202ENSMUST00000116669 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Homer1-203ENSMUST00000080127 3052 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm22267-201ENSMUST00000104008 131 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Mir5617-201ENSMUST00000176786 57 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm33728-201ENSMUST00000217285 546 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2022-201ENSMUST00000220585 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC154558.1-201ENSMUST00000222278 415 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7252-201ENSMUST00000223284 456 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm42397-205ENSMUST00000208692 1449 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm156-202ENSMUST00000118532 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rabgef1Q9JM13 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms