Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Trav5-1-201ENSMUST00000103570 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr859-201ENSMUST00000086480 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Plcz1-201ENSMUST00000032356 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 H3f3c-201ENSMUST00000119459 411 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr1298-201ENSMUST00000119566 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm43093-201ENSMUST00000202439 1213 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 AC153153.2-201ENSMUST00000223572 411 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm16149-201ENSMUST00000117631 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm14791-201ENSMUST00000119061 1166 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm21708-201ENSMUST00000180310 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Ccdc47Q9D024 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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