Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37099-201ENSMUST00000191902 3451 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13533-201ENSMUST00000121104 177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22261-201ENSMUST00000158691 324 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37070-201ENSMUST00000193272 460 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Pomp-203ENSMUST00000201376 383 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4822-201ENSMUST00000077551 479 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10916-201ENSMUST00000080330 483 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm23459-201ENSMUST00000083259 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r184-204ENSMUST00000227534 4807 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Pign-201ENSMUST00000070699 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4831-201ENSMUST00000174626 594 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC165245.1-201ENSMUST00000214181 636 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ccdc28aQ8CEI3 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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