Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Trim2-204ENSMUST00000107692 7161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Map1b-201ENSMUST00000064762 11808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Prl2c1-202ENSMUST00000110335 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm22536-201ENSMUST00000158171 134 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr202-201ENSMUST00000049859 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
NischQ80TM9 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Serpinb10-203ENSMUST00000194951 1194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm28969-205ENSMUST00000186757 1581 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm28990-204ENSMUST00000189255 1581 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm28677-209ENSMUST00000190010 1581 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
NischQ80TM9 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms