Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 AC124556.1-201ENSMUST00000218256 1319 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr1204-202ENSMUST00000213283 6935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r116-201ENSMUST00000164288 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r152-201ENSMUST00000168326 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r95-201ENSMUST00000168984 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r104-201ENSMUST00000169689 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm37614-201ENSMUST00000195645 210 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Rrm2b-203ENSMUST00000137636 900 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm42948-201ENSMUST00000199085 578 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Atg9aQ68FE2 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms